Com en altres aspectes, cal remarcar que pel que fa al clima, els Ports es presenten com una zona amb forts contrastos. Als Ports es pot passar de la calma més absoluta, al "vent de dalt" huracanat, en un no-res. De vegades, quan es gira vent al de tocar, sovintegen les ràfegues de més de 150 km/h.

La uniformitat no té cabuda en aquest entorn natural. Factors com l'altitud, l'orientació i la posició geogràfica del massís són d'especial rellevància per a explicar aquest fet.

Cal destacar la diferència notable que es dóna entre ambdós vessants del massís. El vessant sud-est, d'influència mediterrània, presenta un règim de temperatures molt més suau que el vessant interior, el qual suporta unes condicions més continentals. Amb l'altitud, el clima es transforma en submediterrani, fet que es tradueix en un augment de les precipitacions i una disminució de la temperatura mitjana.

El clima que predomina a la major part del massís, és un clima mediterrani de muntanya amb influència marítima. Es caracteritza per ser menys eixut i una mica més fred que el clima meditarrani de les planes litorals. Fins i tot per damunt dels 1000 m, el clima no deixa de tenir un caràcter mediterrani, amb la marcada presència d'un periode àrid d'un mes a l'estiu; encara que la pluviometria augmenta (fins als 900 mm) en relació a la de les planes basals (aproximadament de 550 mm). La temperatura mitjana també és força contrastada : mentre a les planes i a la depressió de la vall de l'Ebre, la temperatura mitjana està entre els 16 i 17 ºC; als estatges superiors del massís, aquesta temperatura ronda al voltant dels 10 ºC.