El Decret 160/2001, de 12 de juny, de declaració del parc natural dels Ports i de la reserva natural parcial de les Fagedes dels Ports, estableix , per a la gestió del Parc Natural, els òrgans següents:

ARTICLE 11

Òrgan gestor

11.1 La gestió del parc natural dels Ports la duu a terme una unitat tècnica específica, d'acord amb les directrius de la Junta Rectora, l'assessorament de les entitats socials i científiques i amb la participació efectiva, mitjançant el consell de cooperació, de les entitats representatives dels sectors socials interessats.

11.2 La unitat de gestió del parc natural dels Ports s'adscriu al Departament de Medi Ambient i li corresponen les funcions següents:

1. Les funcions que estableix l'article 29.2 de la Llei 12/1985, de 13 de juny, d'espais naturals.
2. Les funcions de suport i assessorament en relació amb els usos tradicionals i les iniciatives públiques i privades congruents amb els objectius i la naturalesa del parc natural.
3. Les funcions referents a la formulació dels instruments de planificació i ordenació del parc natural.
4. L'execució, si s'escau, de les obres i altres actuacions que requereixi la gestió de l'espai.

Direcció

12.1 El director o directora del parc natural és nomenat pel conseller de Medi Ambient, prèvia consulta a la Junta Rectora.

12.2 El director o directora té a càrrec seu el comandament de la unitat de gestió i actua com a secretari o secretària de la Junta Rectora, dels acords de la qual ha d'efectuar la tramitació administrativa.

Junta Rectora

13.1 La Junta Rectora del parc natural dels Ports és l'òrgan rector del parc natural dels Ports.

13.2 La Junta Rectora està composta per 17 membres amb la representació següent:

• Un representant del Departament de Medi Ambient.
• El director del parc natural.
• Un representant del Departament d'Indústria, Comerç i Turisme.
• Un representant del Departament d'Agricultura, Ramaderia i Pesca.
• Un representant del Departament de Política Territorial i Obres Públiques.
• Un representant de l'Institut per al Desenvolupament de les Comarques de l'Ebre.
• Un representant de la Diputació de Tarragona.
• Un representant dels consells comarcals en l'àmbit dels quals se situa el parc natural.
• Quatre representants dels ajuntaments en l'àmbit del qual se situa el parc natural.
• Quatre propietaris particulars, designats per l'entitat o associació que els representi, un dels quals serà de la reserva natural parcial de les Fagedes dels Ports.
• Un representant de les entitats de protecció i defensa de la natura que tinguin presència efectiva en l'àmbit del parc.

13.3 La Junta Rectora té les funcions següents:

1. Establir, d'acord amb les disposicions reguladores del parc natural, les directrius per exercir-ne la gestió.
2. Aprovar inicialment les memòries anuals de gestió. Proposar el pressupost anual d'acord amb les prioritats d'inversions en infraestructures i serveis dins l'àmbit del parc.
3. Coordinar les actuacions que afectin l'espai protegit de les distintes administracions actuants que hi són representades, i fer-ne el seguiment.
4. Ser objecte de consulta preceptiva abans de l'aprovació de les disposicions, els plans i els programes que es formulin per al parc natural.
5. Proposar i promoure mesures i actuacions per a la millor protecció del parc natural, per al foment del coneixement i el gaudi ordenat dels seus valors i per a l'afavoriment de les activitats tradicionals, entre elles, les agrícoles, ramaderes i forestals i el desenvolupament sostenible.
6. Proposar, si escau, un major grau de protecció per als espais que ho requereixin i proposar la declaració de noves figures de protecció o la modificació de les que estableix aquest Decret.

13.4 La Junta Rectora pot crear comissions específiques de caràcter temporal amb finalitats científiques i tècniques per a l'estudi i formulació de propostes per a la protecció dels valors del parc natural. Una comissió elaborarà un reglament de funcionament intern de la mateixa Junta Rectora.

13.5 El president o presidenta de la Junta Rectora és nomenat pel conseller de Medi Ambient d'entre els membres de la Junta Rectora a proposta de la mateixa Junta Rectora.

Consell de Cooperació

14.1 El Consell de Cooperació és l'òrgan col·laborador en la gestió del parc natural, integrat per entitats i associacions representatives dels sectors socials interessats.

14.2 El Consell de Cooperació és integrat per representants de les entitats i associacions següents:

• Un representant de l'estructura administrativa de gestió dels parcs.
• Tres representants del Departament de Medi Ambient.
• Dos tècnics forestals responsables de la gestió pública de l'àrea del parc.
• Un representant de la reserva de caça.
• Un representant del Departament d'Agricultura, Ramaderia i Pesca.
• Un representant de l'Institut per al Desenvolupament de les Comarques de l'Ebre.
• Un representant del Departament d'Indústria, Comerç i Turisme.
• Un representant del Departament d'Interior.
• Un representant del Departament de Política Territorial i Obres Públiques.
• Nou representants dels Ajuntaments en l'àmbit del qual se situa el parc natural.
• Tres representants dels consells comarcals en l'àmbit del qual es situa el parc natural.
• Un representant de la Diputació de Tarragona.
• Quatre representants de les organitzacions professionals agràries en proporció als resultats de les eleccions a cambres agràries.
• Nou propietaris particulars, designats per l'entitat o associació que els representi.
• Tres representants dels moviments excursionistes, conservacionistes o de centres d'estudis de la zona del parc natural en l'àmbit del qual se situa el parc natural.
• El director del parc, que actuarà com a secretari.

14.3 És president del Consell de Cooperació el president de la Junta Rectora.

14.4 Són funcions del Consell de Cooperació:

1. Establir criteris i promoure mesures per coordinar harmònicament els interessos i les activitats dels sectors representatsamb els objectius i l'actuació del parc natural.
2. Fomentar la cooperació de les entitats que hi són representades, o d'altres que es dediquin als mateixos objectius que els que disposa aquest Decret, amb el parc natural i la seva gestió, i concertar amb aquesta finalitat actuacions d'interès comú.
3. Plantejar a les administracions actuants iniciatives, propostes i suggeriments adreçats a la defensa dels interessos representats i a l'assoliment de les finalitats de cooperació, harmonització i participació, i, en general, dels objectius específics de les àrees protegides.
4. Emetre informes sobre els afers que els altres òrgans del parc natural sotmetin a la seva consideració.

14.5 El Consell de Cooperació ha de ser informat regularment dels plans, els projectes i les actuacions duts a terme en la gestió del parc natural.